A principios del siglo XIX será escenario de acontecimientos nacionales como: la reunión que se celebró a objeto de proclamar a Bolívar "Capitán General de los ejércitos de Venezuela, vivo y efectivo y con el nombre de Libertador" y en 1842 este templo recibió sus restos.

En 1887 Guzmán Blanco decreta la modernización del mismo y embellece los retablos, los cuales por su grandiosidad, pueden competir fácilmente con los de España y méxico.

La iglesia posee un bello altar con un retablo del santo niño de Belén, terminado para el año 1767. Otros que destacan son el retablo Mayor de San Francisco, retablo de La Orden Teresa de San Francisco, con bellas pinturas de santos ejecutadas por el pintor Juan Pedro López, el retablo del Corazón de Jesús, de la Santísima Trinidad y el retablo de Nuestra Señora de Coromoto, entre otros que guardan especial interés histórico y religioso para el país.